Az MRI tomográfia egy nagyon pontos módszer a testben levő betegségek meghatározására. A test legkülönbözőbb részein levő elváltozások is felderíthetők a segítségével. A fejben például láthatóvá lehet tenni agyvérzés, vagy daganatok miatt létrejött elváltozásokat, ütőér-tágulatot, sőt még gerincvelő-gyulladást is.

Az MRI tomográfia segít felfedezni a szív és az érrendszer egyes rendellenességeit is (pl. ütőértágulat). Fontos információkat adhat a hasi szervekről, vagy akár a lágy szövetek, és az izületek állapotáról. Segíti a sebészeket abban, hogy már a feltárás előtt tájékozódjanak az elváltozások pontos helyéről és mértékéről, s ezzel a sebészeti beavatkozást is csak a minimálisan szükséges mértékre csökkenthessék.